En la temporada 1965/66 volvió a descender y no regresaría a la Primera División hasta lograr el tercer campeonato de la Segunda División en la temporada 1969-1970. En esa ocasión no hubo descenso en la Primera División aumentando los equipos de 16 a 18 y el Zacatepec fue el equipo N°17 y los Camoteros del Puebla que había ganado una promoción fue el equipo N°18. El equipo descendió por primera vez el 31 de diciembre de 1961 y se quedaron ahí hasta la siguiente temporada 1962/63, donde obtuvieron el campeonato de la segunda división y así volvieron a primera división.
